มีหน้าที่รับผิดชอบการเบิกจ่ายเงินงบประมาณแผ่นดินและเงินนอกงบประมาณทุกประเภท เพื่อสนับสนุนภารกิจตามพันธกิจของคณะเวชศาสตร์เขตร้อน ด้านการเรียนการสอน การวิจัย การบริการวิชาการ การบริการรักษาพยาบาล การทำนุบำรุงศิลปวัฒนธรรมและการบริหารของคณะฯ ให้ดำเนินงานไปได้ด้วยดี  และมุ่งสู่วิสัยทัศน์