คณะเวชศาสตร์เขตร้อน มหาวิทยาลัยมหิดล มีผลการประเมินคุณธรรมและความโปร่งใสในการดำเนินงานของหน่วยงาน ผลคะแนน ITA เท่ากับ 80.06 คะแนน ระดับผลการประเมิน : B  ซึ่งระดับผลการประเมิน ( Rating Score) อยู่ในระดับดี โดยพิจารณาคะแนนการประเมินจากกลุ่มตัวอย่างผู้มีส่วนได้ส่วนเสียภายใน และผู้มีส่วนได้ส่วนเสียภายนอก คะแนนผลการประเมินตามเครื่องมือการประเมิน พบว่าผลการดำเนินงานยังมีมิติที่ “ ไม่ผ่าน” ตามเกณฑ์การประเมินคุณธรรมและความโปร่งใส่ของหน่วยงานภาครัฐ (Integrity and transparency Assessment: ITA) ในปี พ.ศ. 2566 ประกอบไปด้วย 1. การรับรู้ของผู้มีส่วนได้ส่วนเสียภายใน (Internal Integrity and Transparency Assessment : IIT)  2. การวัดการรับรู้ผู้มีส่วนได้ส่วนเสียภายนอก (External Integrity and Transparency Assessment : EIT) 3.การเปิดเผยข้อมูลสาธารณะ (Open Data Integrity and Transparency Assessment : OIT)  จากผลการประเมินมีประเด็นข้อบกพร่องหรือจุดอ่อนที่จะต้องแก้ไขโดยเร่งด่วน และต้องพัฒนาให้ดีขึ้นโดยมีรายละเอียดผลการประเมินรายตัวชี้วัดในภาพรวม ดังนี้