ฝ่ายเลขานุการสวัสดิการเพิ่มเติมคณะเวชศาสตร์เขตร้อนทำหน้าที่ดำเนินการและประสานงานกับคณะทำงานทุกฝ่าย เพื่อให้การจัดสวัสดิการด้านการช่วยเหลือเงินสวัสดิสงเคราะห์ การรักษาพยาบาลและสุขภาพ การกีฬาและนันทนาการ การให้ทุนการศึกษาสำหรับบุตรบุคลากรคณะเวชศาสตร์เขตร้อน การจัดกิจกรรมสวัสดิการต่าง ๆ ซึ่งเป็นสวัสดิการเพิ่มเติมนอกเหนือจากสวัสดิการที่ทางราชการ หรือมหาวิทยาลัยมหิดลจัดให้เป็นกรณีปกติ ได้ขับเคลื่อนและเป็นประโยชน์ต่อผู้ปฏิบัติงานมากที่สุด