ศูนย์วิจัยโรคเขตร้อนกาญจนบุรี มีวัตถุประสงค์เพื่อสนับสนุนการเรียนรู้และพัฒนาศักยภาพของนักศึกษา นักวิจัย และบุคลากรทางการแพทย์ ทั้งในและนอกสังกัดคณะเวชศาสตร์เขตร้อน โดยจัดเตรียมพื้นที่และสิ่งอำนวยความสะดวกสำหรับการฝึกภาคสนามในพื้นที่จริง ซึ่งเป็นหัวใจสำคัญของการศึกษาด้านเวชศาสตร์เขตร้อนที่ไม่สามารถเรียนรู้ได้ครบถ้วนภายในห้องเรียน นอกจากนี้ศูนย์ฯ ยังเป็นสถานที่จัดกิจกรรมทางวิชาการ อาทิ Academic Forum การอบรมเชิงปฏิบัติการ และการประชุมแลกเปลี่ยนความรู้ระหว่างนักศึกษาและผู้เชี่ยวชาญ เพื่อเสริมสร้างประสบการณ์ตรงควบคู่ไปกับความรู้เชิงทฤษฎี