การเดินทางมาคณะเวชศาสตร์เขตร้อน มหาวิทยาลัยมหิดล สามารถเดินทางได้อย่างสะดวกด้วยรถไฟฟ้า BTS ลงสถานีอนุสาวรีย์ชัยสมรภูมิ ทางออก 3 แล้วเดินเท้าต่อประมาณ 750 เมตร หรือใช้บริการรถประจำทางสายที่ผ่านถนนราชวิถี นอกจากนี้ยังสามารถเดินทางด้วยรถยนต์ส่วนตัวหรือรถแท็กซี่โดยเข้าทางถนนราชวิถีมุ่งหน้าแยกตึกชัยได้เช่นกัน